部立桃園醫院的群聚感染事件持續延燒!此次院內感染疫情的源頭應來自案812美國境外移入個案,而根據疫調發現,前5例確診者體內均驗出武漢肺炎病毒(SARS-CoV-2)之後在歐美流行,且目前也是世界上主流的變異病毒株D614G,並發現帶有L452R位點的突變。究竟帶有L452R位點突變的病毒株是否會造成傳播力增加?以及是否有可能被WHO認證成為下一種變異病毒株?
有關這一些困惑,根據美國加州大學病毒學家邱超博士(Dr. Charles Chiu)與加州政府公衛部門合作,於2021年1月17日公布對於帶有L452R位點突變的D614G變異病毒株的研究發現,L452R位點突變會直接影響病毒進入人體的刺突蛋白(Spike protein)的變異。至於此變異是否會造成傳播力因此而增加,研究人員認為還需要進一步證實。
對於外界疑惑帶有L452R位點突變的D614G變異病毒株,是否會成為下一種新的變異病毒株?日前1月21日,中央流行疫情指揮中心羅一鈞醫療應變組副組長曾經提到,雖然部桃群聚感染首5例患者身上均驗出帶有L452R位點突變的D614G變異病毒株,不過此還未經WHO認證為新的「變異病毒株」,且目前還沒有證據支持其傳播力或致病力有改變。因此,以保守來說,目前這個L452R,的確有可能成為新的變異病毒株的「候選人」。
目前許多人有一個迷思,即擔心如果新的點突變出現,是否就等於是出現了新的變異病毒株?其實,由於冠狀病毒屬於容易突變的RNA病毒,因此發現有新的點突變是常見的。而要成為新的變異病毒株的關鍵在於:是否該突變處會造成病毒的傳播力或致病率上升等影響。
部立桃園醫院的群聚感染事件持續延燒!此次院內感染疫情的源頭應來自案812美國境外移入個案,而根據疫調發現,前5例確診者體內均驗出武漢肺炎病毒(SARS-CoV-2)之後在歐美流行,且目前也是世界上主流的變異病毒株D614G,並發現帶有L452R位點的突變。
除了值得關注帶有L452R位點突變的D614變異病毒株是否有機會成為新變異病毒株的「候選人」之外,根據世界衛生組織(WHO)公布,從去年由SARS-CoV-2所引起的COVID-19開始流行後,目前全球主要有4種變異病毒株。以下一次帶您看懂變異病毒株的演變史:
變異病毒株始祖:SARS-CoV-2病毒株
2019年12月中國湖北省武漢市發現多件病毒性肺炎案例,至2020年1月7日實驗室檢驗出一種新型的冠狀病毒,且在1月10完成病毒的核酸檢測(病毒定序),1月12日世界衛生組織(WHO)將此病毒命名為「2019 新型冠狀病毒(2019-nCoV) 」。
同年2月11日,國際病毒學分類學會(International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV)將病毒「2019-nCoV」正式命名為 Severe Acute Respiratory Syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2),中文為「嚴重急性呼吸症候群冠狀病毒第二型」,WHO 同時將此病毒引起之「疾病」正式命名為「COVID-19」。台灣則於2020年 1 月 21 日出現第1起境外移入確診個案,同時,歐美中亞各國陸續發病人數,也明顯有上升趨勢。
到底什麼是冠狀病毒?冠狀病毒是屬於單股RNA病毒,相較於DNA病毒較不穩定,容易突變;而之所以稱「冠狀病毒」,是因為外觀有類似皇冠狀的突起,這些突起的物質稱做「刺突蛋白」或「棘蛋白」(spike protein),屬於一種糖蛋白,也是病毒進入人體細胞的「鑰匙」。
當RNA上的核苷酸發生點突變,所轉譯出來的胺基酸就有可能被改變,當病毒原本的胺基酸被改變成另一種胺基酸,而造成病毒傳播力或致死率增強時,就可能造成新變異病毒株的出現。
冠狀病毒是屬於單股RNA病毒,相較於DNA病毒較不穩定,容易突變;而之所以稱「冠狀病毒」,是因為外觀有類似皇冠狀的突起,這些突起的物質稱做「刺突蛋白」或「棘蛋白」(spike protein),屬於一種糖蛋白,也是病毒進入人體細胞的「鑰匙」。
SARS-CoV-2病毒即為造成COVID-19大流行的初始主流病毒。而此病毒株也是以下陸續出現,且已經被世界衛生組織(WHO)認證的4種變異病毒株的「祖先」。 (未經時間排序):
D614G變異病毒株
最初在歐美流行,在2020年1月下旬或2月出現,此變異病毒株在數月後,已逐漸取代之前在大陸發現的SARS-CoV-2病毒,而成為主流病毒。D614G點突變的意思是病毒轉錄第614個胺基酸的位置的核苷酸發生點突變,使該位點原本胺基酸由原本的天門冬氨酸(代號D)轉變為甘胺酸 (代號 G)。
根據具有權威性的國際期刊《科學》(Science)於2020年12月底的研究報告指出,研究者透過細胞與動物研究發現,D614G位點突變會增加新冠病毒的感染與傳播,不過目前還未有證據顯示會影響傳染後的嚴重度。
Cluster5丹麥水貂變異病毒株
2020年8月至9月在位於丹麥的水貂繁殖場發現。根據世界衛生組織WHO在2020年11月6日公布的新冠肺炎疾病爆發新聞指出,新冠病毒透過水貂回傳給人類的情況可以回溯到2020年6月,特別是在同年9月發現,12位被水貂傳染新冠病毒的病患中,有一些獨特的病毒變異(Cluster 5),即丹麥水貂變異病毒株,為防止病毒繼續變異,超過1000個丹麥水貂養殖場共計1700萬隻水貂都被撲殺。目前此變異病毒株已經隨著大規模撲殺水貂,而幾乎消失。
冠狀病毒屬於RNA病毒,當單股RNA上發生點突變,且對傳播力或致病力造成影響時,即可能成為新的變異病毒株。
VOC 202012/01B.1.1.7英國變種病毒
英國當局在2020年12月14日對世界衛生組織(WHO)通報,並被命名為「VOC-202012/01」(Variant of Concern, year 2020, month 12, variant 01)(即為B.1.1.7),由初步的流行病學研究顯示,英國變種病毒的傳染力較強,根據統計,在2020年12月30日前,除了英國以外,已有31個國家出現感染此變種病毒的案例。在2021年1月22日英國首相強森(補英文)宣布最新消息表示,英國變種病毒相較於其他變異病毒株的致命力更強。
英國政府首席科學顧問瓦倫斯(Patrick Vallance)也表示,據統計在英國每1000名60歲以上的男性確診病患中,原始的新冠病毒株SARS-CoV-2可能導致10名患者死亡﹔而目前發現變異病毒株B.1.1.7可能造成13~14名患者死亡,死亡率提高約30%。
南非變種病毒501Y.V2
南非衛生當局於2020/12/18宣布檢測到SARS-CoV-2的新變種於第501個胺基酸位發現有點突變,導致原本的天門冬醯胺(代號N)轉變為酪胺酸(代號Y),所以命名為501Y.V2,此新的變異病株,最早於2020年8月初出現在東開普省(Eastern Cape Province)到納爾遜曼德拉灣的海岸(Nelson Mandela Bay),到同年11月初已經成為東開普省以及西開普省的主要流行病毒株,後來陸續在英國以及其他各國皆有出現。
根據科學家初期研究,此變異病毒株有較高的病毒量,因此擴散較快,不過是否有較高的致死率,目前還無證據顯示。截至2020年12月30日,除了南非之外,還有其他4個國家有出現南非變種病毒501Y.V2的蹤跡。
首次在加州發現帶有L452R位點突變的病毒似乎對疫苗有抵抗力。
認識以上4種變異病毒株演變之外,目前仍然令人擔心的是,帶有L452R位點突變的病毒,是否對於現在的疫苗敏感性會有下降的可能?以下是美國加州大學舊金山分校(UCSF)的病毒學家兼加州大學微生物病理實驗室與加州政府合作的邱超教授(Dr. Charles Chiu)與加州政府單位合作,研究此帶有L452R位點突變的D614G突變病毒株後所做出最新的解釋:
首次在加州發現帶有L452R位點突變的病毒似乎對疫苗有抵抗力。此變異種於2020年3月在丹麥首次被發現,根據《泰國醫學新聞》(Thailand Medical News)報導,邱超教授(Dr. Charles Chiu)在訪問中提到,目前對染疫者的病毒樣本做基因定序後發現,現有的疫苗較不易對此種變異病毒發揮作用,但帶有L452R位點突變的病毒是否真的具有對病毒產生抵抗力的特性還需要進一步的觀察。
帶有L452R位點突變的病毒,直接影響與人體細胞受體結合的刺突蛋白
研究人員擔心帶有L452R位點突變的病毒可能造成病毒的刺突蛋白,也就是病毒進入人體細胞的「鑰匙」產生變異。刺突蛋白是目前研發出的疫苗的標靶,而刺突蛋白的突變可能會使由SARS-CoV-2變異出的變異病毒株對疫苗的敏感度下降。邱超教授(Dr. Charles Chiu)表示,此變異體在刺突蛋白中帶有3個突變,其中L452R位點突變直接影響到病毒與人體細胞的受體接合,且此為美國可以買到兩種疫苗的標靶的位置。
帶有L452R位點突變的病毒目前在加州呈指數型成長
另外,邱超教授(Dr. Charles Chiu)也提到,帶有L452R位點突變病毒的比率目前在加州當地社區持續上升,從2020年11月下旬約佔染病樣本數的3.8%,在2020年12月下旬至2021年1月初,短短不到2個月,帶有L452R位點突變的病毒樣本已暴增到25.2%。
加利福尼亞公共衛生部的流行病理學家埃里卡.潘博士(Dr. Erica Pan)指出,目前對於斷定此變種病毒是否具有更強傳播力還言之過早,但無疑的是,需要戴好口罩做好防護以及減少和人群互動的機會並與染疫者做好隔離,以保護自己和親人是必須的。
洛杉磯市公共衛生總監(Los Angeles County Department of Public Health)芭芭拉·費雷爾(Dr. Barbara Ferrer)指出,目前此變種病毒的病例呈現指數型成長的階段,如果再不加以控制,帶有L452R位點突變的病毒將在3月成為新冠肺炎主要的病毒類型。
對於帶有L452R位點突變的病毒是否具有更強的傳播力?還有待證實
對此,美國加利福尼亞公共衛生部的流行病理學家埃里卡.潘博士(Dr. Erica Pan)指出,目前對於斷定此變種病毒是否具有更強傳播力,還言之過早,但無疑的是,需要戴好口罩做好防護,以及減少和人群互動的機會並與染疫者做好隔離,以保護自己和親人是必須的。
部桃驗出歐美主流病毒株傳播力強?新變異病毒株又出現?一次看懂病毒演變史
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